این واحد زیر مجموعه اداره پذیرش و ثبت نام بوده و فرآیندهای آموزشی مرتبط با پذیرفته شدکان مقاطع تحصیلی دستیاری تخصصی بالینی، دستیاری فوق تخصص، فلوشیپ (دوره تکمیلی تخصص) و دستیاری تخصصی دندانپزشکی از بدو ثبت نام تا اتمام دوره از جمله ثبت نام، میهمانی، انتقالی و ... را برعهده دارد. پایش و نظارت بر عملکرد دانشکده های مرتبط با مقاطع تحصیلی یاد شده از دیگر وظایف این واحد می باشد.
متقاضیان انتقالی در دوره دستیاری تخصصی بالینی می توانند جهت ثبت نام و ثبت درخواست خود به سامانه نقل و انتقال دستیاری وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی به نشانی SpecialistTransmition.Behdasht.gov.ir مراجعه نمایند. بدیهی است جزییات، مدارک لازم و زمانبندی ثبت نام توسط وزارت متبوع از طریق آن سامانه اطلاع رسانی می گردد.
برنامه آموزشی رشته های مختلف مقاطع فوق تخصص و فلوشیپ در سایت دبیرخانه شورای آموزش پزشکی و تخصصی وزارت بهداشت به نشانی CGME.Behdasht.gov.ir قابل مشاهده می باشد.